У 2007 році між кафедрою програмного забезпечення та комп'ютерних систем та канадською компанією VoIP Shield Systems Inc. (16, Fitzgerald Road, Ottawa, Ontario, Canada) було укладено угоду про співробітництво в галузі ІТ-технологій, згідно з якою компанія відкрила при кафедрі лабораторію ІР-телефонії та обладнала її комп’ютерною технікою та програмним забезпеченням. На основі цієї лабораторії в Чернівцях було відкрито філію компанії VoIPShield, де працювали випускники та студенти факультету комп’ютерних наук. У наступні роки вони пройшли стажування на головній компанії в Канаді. У 2013 році відновлено функціонування Чернівецької філії. Сьогодні ця філія перетворилася в компанію DataWiz.
З 2016 року викладачі кафедри активно розробляють спільні проєкти в галузі інформаційної безпеки з компанією Oculus Technologies LLC з Об’днаних Арабських Еміратів, особливість яких полягає у значній дослідницькій науково-технічній складовій. До робіт залучаються студенти старших курсів та магістранти.
У квітні 2010 року укладено угоду про співпрацю та спільні науково-технічні розробки з Max Stern College of Emek Yezreel, Israel, згідно з якою науковці виконують спільні дослідження статистичних характеристик складних мереж. З ізраїльського боку угоду виконує проф. Ігор Кановський, з боку кафедри — проф. Остапов С.Е. та асист. Кириченко О.Л. Розроблено оригінальне програмне забезпечення та виконано порівняльні дослідження статистичних закономірностей українських та ізраїльських доменів глобальної мережі Інтернет.
У січні 2017 року проф. Остапов С.Е. відвідав Max Stern College of Emek Yezreel, Israel. У вересні 2017 року планується візит проф. Кановського І.Я. до Чернівецького національного університету для виконання спільних досліджень та читання лекцій.
Кожного року аспіранти кафедри ПЗКС беруть участь у міжнародній Літній Школі з Інформатики «Еволюційні обчислення в оптимізації та збору даних» (Evolutionary Computing in Optimization and Data Mining, ECODAM), яка проводиться факультетом комп’ютерних наук Ясського університету ім. А.Й. Кузи (Ясси, Румунія), де доповідають про результати своєї наукової роботи. Такий обмін інформацією між молодими науковцями Румунії, Молдови та України сприяє, по-перше, науковому зростанню аспірантів, а по-друге, — міжнародному іміджу нашої кафедри та університету в цілому.
Стійкі зв’язки підтримує кафедра ПЗКС також з ЗВО Польщі. Проф. Остапов С.Е. неодноразово відвідував Вищу школу бізнесу у Добровій Гурнічій, як для участі у міжнародних конференціях (як запрошений доповідач), так і для узгодження та впровадження подвійних дипломів для студентів ІТ-спеціальностей ЧНУ. Він є постійним членом програмного комітету міжнародної конференції «Internet in the information society — IWSI».
Щороку студенти спеціальності «Інженерія програмного забезпечення» виграють гранти за програмами обміну студентами з країнами Євросоюзу та вчаться протягом семестру у ЗВО Польщі, Румунії, Німеччини, Австрії та інших країн. Викладачі кафедри також проходять стажування у країнах Євросоюзу за грантами Вишеградської Четвірки, Erasmus Mundus, Erasmus+, Emerge та інших.
З 2018 року кафедра співпрацює з Братиславською вищою школою економіки та менеджменту в громадському управлінні. Для підтримання високого рівня міжнародних стосунків сторони обмінюються візитами викладачів, планується розширення взаємодії, зокрема, організація спільних семінарів та науково-технічних конференцій.
